События разворачиваются вокруг девушки по имени Саори Кидо, обеспокоенной своими таинственными силами. Однажды, при покушении засланного киллера, ее спасает некий юноша, представившийся как Сэйя, после чего девушка узнает шокирующую истину — она является реинкарнацией греческой богини — Афины, а Сэйя — один из ее 88 святых. Осознавая свое предназначение, Саори отправляется к Святилищу для ведения войны с тамошним...