...

Новая история во вселенной аниме и манги «Югио!». Дуэльная академия является одной из самых престижных академий для дуэлянтов во всём мире. История разворачивается вокруг Дзюдая Юки, решившего стать учеником академии. Пройдя вступительный экзамен, он попадает в «Красный Осирис», одно из трёх общежитий, где знакомится с Сё Маруфудзи и встречает своего будущего главного соперника из «Синего Обелиска» Дзюна Мандзёмэ....

Археологам довелось обнаружить ранее неизведанную гробницу одного из египетских богов, Анубиса, который после этого воскрес из многовекового сна, чтобы одолеть Фараона. Тем временем закончился Баттл-Сити — турнир, устроенный Сэто Кайбой, чтобы заполучить карты трёх всесильных богов, и теперь Юги, одержавший победу в турнире, стал известен во всём мире. Также Сэто узнаёт, что у Пегаса есть карта, способная одолеть...