...

Дзюн, его спутница Рэми и её младший брат Тёби отправляются в меловой период на летающей тарелке....

Действие «Могилы Светлячков» разворачивается в сороковые годы прошлого века, в последние месяцы Второй Мировой войны. Положение Японии удручающее – солдаты гибнут на войне, которая уже кажется проигранной, мирному населению не хватает пищи. Главные герои аниме – юноша по имени Сэйта и его младшая сестра Сэцуко - живут в городе Кобэ с матерью. Отец в это время служит в Императорском Флоте, и от него пока нет вестей....

Мы переносимся в далёкое будущее, где человеческая раса практически лишена каких-либо надежд на счастливое будущее. При создании искусственного интеллекта учёные уверяли, что человечество стоит на пороге новой эпохи, где не будет места для несправедливости, войн и беззакония. Вот только они не понимали, что своими действиями толкают нашу планету прямиком в пропасть, что приводит к самым катастрофическим...